Synthèse ADN nouvelle génération

Aperçu

Développement de méthodes de synthèse d’ADN de nouvelle génération

Yannick RONDELEZ, DR CNRS

Anthony GENOT, CR CNRS

La synthèse de l’ADN est réalisée classiquement en faisant croître le polymère pas à pas via des cycles de couplage/déprotection des bases. L’approche historique, qui utilise la chimie des phosphoramidites, ne semble pas adaptée aux futurs besoins en stockage de données sur ADN, compte tenu de la faible vitesse de synthèse et de la difficulté à créer de longs brins.

Une approche de synthèse plus récente utilise le couplage enzymatique avec des polymérases. Cette technique est plus respectueuse de l’environnement mais reste encore lente et coûteuse.

Le projet NGSD (Next Generation Synthesis of DNA) a pour principal objectif de développer une nouvelle génération de synthèse d’ADN, plus rapide est mieux adaptée aux contraintes liées au stockage de l’information digitale. Cette synthèse sera plus rapide et évolutive. A terme, ces technologies devront permettre une intégration sur des micropuces parallélisées d’ici la fin du projet. 

Mots clés : synthèse enzymatique d’ADN, haut débit, microfluidique, encodage rapide

Les missions

Nos recherches

Créer de nouvelles briques chimiques

Concevoir et préparer des monomères et des nucléotides spécialisés pour la synthèse enzymatique. Une installation dédiée à la production de nouveaux synthons va être créée. 

Assembler les briques chimiques

Créer et optimiser des outils enzymatiques pour augmenter l’efficacité et la rapidité du codage moléculaire

Miniaturiser et paralléliser la synthèse de l’ADN

Optimiser et adapter des technologies matricielles et les combiner avec des techniques de micropatterning et microfluidique

Intégrer cette nouvelle chimie dans un processus complet

Intégrer les dispositifs, les enzymes et les blocs chimiques et les combiner avec le codage et le décodage du projet « De la donnée numérique à l’ADN »